Endometrioza se poate trata chirurgical sau prin folosirea unor medicamente antiinflamatoare care sunt cel mai des folosite in tratarea endometriozei pentru a indeparta durerea din zona pelvina. De asemenea in tratarea endometriozei se mai folosesc si contraceptivele orale care se bazeaza pe intreruperea productiei normale de hormoni ceea ce provoaca inhibarea cat si intreruperea dezvoltarii celulelor endometriale.