Între ele este forma corectă. Nu am auzit și nici văzut vreodată varianta intr-e ele!
Eu n am auzit in viata mea de " intr-e ele "
Nici nu cred ca exista... logic ca intre ele este corect.
"Între ele", evident. Cratima leagă două părți de vorbire diferite. Citeste pe Google, o sa înțelegi mai bine cum sta treaba.