Povestea din Kamichama Karin e despre o fata orfana, Karin Hanazono, care locuieste cu matusa ei. Viata ei a fost mai mereu grea si fara prieteni. La scoala are rezultate slabe, este slaba la sport sau alte activitati. Singurul ei prieten a fost o pisica Shii-chan, dar care a murit, Karin avand doar un singur obiect pretios pentru ea, un inel care a apartinut mamei sale.
Intr-o zi viata ei se schimba brusc, pe cand se afla la mormantul pisicii intalneste un baiat pe nume Kazune Kujyo si mai tarziu pe verisoara lui, Himeka, amandoi fiind orfani, ca si Karin. Incepand din acea zi in viata lui Karin apar diferite momente misterioase: brusc ia note mari la scoala, dar pentru scurt timp, si i-se implineste dorinta de a ploua pentru a fi anulata ora de sport.
Intalnindu-se din nou cu Kazune si verisoara lui, Karin afla de la ei ca este o mica zeita cu puteri misterioase obtinute prin inelul mamei sale. Vor apare si altii cu puteri asemanatoare, care sunt de partea raului si o urmaresc pe Himeka.
Pentru a se antrena ca sa poata folosi bine puterile de zeita sa poata infrunta pe cei rai, Karin se va transfera la aceeasi scoala unde invata Kazune si se va locui impreuna cu el si cu Himeka.