Cauza acestei afectiuni poate fi, in multe dintre situatii, obstructia cavitatii organului (apendicele vermiform), din cauza unei proliferari limfatice stimulate bacterian sau din cauza unui mic corp strain (samburi, seminte).
Aceasta provoaca o crestere a presiunii din interiorul organului, o tulburare a circulatiei sangelui din peretii organului si inflamatia acestuia ce poate evolua in lipsa tratamentului corespunzator pana la perforatie (peritonita).
Poate fi luata in discutie si o predispozitie genetica pentru apendicita in cazul familiilor cu mai multe persoane operate de aceasta afectiune.
Cel mai adesea este provocata de oprirea in apendice a unui corp strain: coji de seminte, samburi de cirese, masline, pepene, struguri, ardei gras sau coproliti (pietricele formate in intestin din sarurile din apa si alimente). Rareori pacientii cu apendicita acuta fac ceva special care sa declanseze boala (de exemplu mananca seminte cu coji cu tot). Cel mai adesea, boala apare din senin.