Vezi în setările programului ce tip de font folosește (codificarea - unicode, iso nuștiucât... și jonglează pe acolo). Sau la setările Window$, cum ți-a spus deja altcineva.
Ctrl+H activeaza functia Replace din editorul de subtitrare/de text. Daca fiecare litera cu diacritice are un semn aparte, in prima casuta pui semnul nedescifrabil, iar in a doua litera cu diactritice cu care sa se inlocuiasca in intreaga subtitrare. Asa procedezi pentru fiecare litera in parte si apoi salvezi subtitrarea cu noile modificari.
Verifica in Windows in control panel-region and language-administrativ-language for non-unicode format-change locale (Romania).
Restart si vezi daca iti mai arata diacritice.
In loc sa le corectezi pe fiecare apesi Ctrl+H, in prima casuta introduci caracterul iar in a doua casuta introduci litera cu care vrei sa il inlocuiesti.