Programele pot fi rulate la startup chiar daca nu le vezi cu msconfig. Am avut odata un virsus care se bagase in driverul de difuzor...
Incearca intai cu niste programe anti malware, de genul Spybot. Daca nu reusesti, si nu e prea mare efortul, fa-ti backup la ce ai important si reinstaleaza windowsul.